影片根据中国古代神话故事《山海经》所记载的周饶小人国传说改编而成，讲述了周饶小人国的王子锤木，在意外之中闯下大祸，导致父亲变成石像，最后一路经历冒险，重新拯救了父亲和王国的故事。...

两个完全不同的英雄为了阻止邪恶外星人Drek主席摧毁索拉纳星系的星球而战斗。瑞奇是他的种族的最后一员，他在一个无人问津的星球独自长大。叮当是一个智力大于体力的小型机器人。当两人遇到了一个足以摧毁整个星球的危险武器时，他们必须加入名为银河流浪者的部队才能拯救整个星系。一路上，他们会学习到英雄主义、友情、以及发现自己身份的重要性。...

　　将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！　　这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！　　神龟们又处于备战状态了...